【多组学和临床转化系列】不是所有问题都要做单细胞：先看你需要哪层证据

科室讨论课题时，常有人问：“这次要不要做单细胞？”先把问题换成一句临床语言：我想解释的，究竟是患者之间的差别，还是组织里某类细胞的变化？

比如，已经有候选蛋白，只想确认它在组织中的位置，可能先做免疫染色就能回答当前问题。技术怎么选，要看缺的是哪层证据。

你的问题，对应哪种检测？

这张表用于初选。具体能不能做，还要结合材料条件和后续验证来判断。

测到“变多”，就能说“作用更强”吗？

单细胞发现表达变化，提供的是功能线索，不能直接证明该细胞发挥了某种作用。两个信号在空间上相邻，也不能单凭位置认定它们存在相互作用。

代谢组尤其容易被误读：代谢物多，不等于通路流量大。 它可能因为合成增加、消耗减少或转运改变而积累。要研究通量，也就是代谢过程的流动速率，需要适配的示踪与分析。

同样，蛋白丰度表示测到了多少蛋白，丰度高也不等于活性高。这些区别会直接影响下一步该补什么实验。

手上的样本，支持这条路线吗？

新鲜组织、冷冻组织和石蜡材料，适配的检测路线不同。选技术时还要一起考虑：

• 独立患者例数是否支持计划中的比较？细胞再多也不能补上患者数。
• 预期的组间差异是否容易检出？
• 找到线索后，有没有材料和条件复核？

对临床医生来说，样本常常来之不易。送检前把这些条件列清楚，才知道这批材料能回答多大的问题。

预实验最该解决什么？

把疑问写具体：材料能不能检测，流程能不能跑通，结果质量是否够用。先确定要回答的问题，再用预实验检查路线是否可行，比不断增加检测项目更有助于推进研究。

参考阅读

• Profiling cell identity and tissue architecture with single-cell and spatial transcriptomics. *Nat Rev Mol Cell Biol*, 2025.

课题该选哪种检测？把研究问题、样本类型和拟比较人群发给我们，一起讨论技术路线。联系 叶博士 13780009482。

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